O CAEM (Centro de Animação e Estudos Missionários) é o departamento do CCM que proporciona cursos de formação missionária para brasileiras e brasileiros enviados a outros países, para presbíteros, seminaristas, religiosas e religiosos, leigas e leigos que atuam em regiões e projetos missionários no Brasil, ou que desejam fortalecem sua motivações missionárias. Ao longo do ano o CCM oferece uma série de cursos e formações que são planejados, organizados e promovidos através do CAEM.